Theo quy hoạch chung, Thị trấn sinh thái Phúc Thọ có tổng diện tích đất nằm trong phạm vi nghiên cứu lập quy hoạch khoảng 1.050ha. Phạm vi quy hoạch có tổng diện tích khoảng 870ha, trong đó diện tích phát triển đô thị tối đa khoảng 400ha.

Thị trấn sinh thái Phúc Thọ gồm ranh giới hành chính thị trấn Phúc Thọ hiện hữu và một phần các xã Phúc Hòa, Trạch Mỹ Lộc, Phụng Thượng, huyện Phúc Thọ và các xã Đại Đồng, Cẩm Yên huyện Thạch Thất.

Theo đồ án Quy hoạch chung xây dựng Thủ đô Hà Nội đến năm 2030 và tầm nhìn đến năm 2050, Thị trấn sinh Thái Phúc Thọ là trung tâm hành chính, chính trị, kinh tế, văn hóa xã hội huyện Phúc Thọ, đồng thời là trung tâm hỗ trợ phát triển vùng nông thôn huyện Phúc Thọ với các cơ sở công nghiệp chế biến lương thực, thực phẩm gắn với tiểu thủ công nghiệp làng nghề, dịch vụ công cộng, dịch vụ logistics hỗ trợ nông nghiệp công nghệ cao và các dịch vụ hỗ trợ sản xuất khác, chuyển giao công nghệ và đào tạo...