Tuy nhiên, theo lãnh đạo Kiểm toán Nhà nước, nguồn thu này sẽ còn lớn hơn rất nhiều nếu được kiểm toán chặt chẽ. Theo Kiểm toán Nhà nước, một trong những nhược điểm chính sách lớn nhất trong lĩnh vực này hiện nay là đối tượng thuộc diện phải tuân thủ chính sách thu tiền sử dụng đất còn hạn hẹp, mà chưa kiểm toán được các đối tượng xin cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất có phát sinh nghĩa vụ tài chính.

Bên cạnh đó, thời gian qua cũng mới chỉ kiểm toán được nội dung về thu tiền sử dụng đất mà chưa kiểm toán về quy hoạch sử dụng đất; chuyển đổi mục đích sử dụng đất, giao đất, quản lý, sử dụng nguồn thu từ đất... Vì vậy, Kiểm toán Nhà nước kiến nghị tới đây cần mở rộng, xem xét đưa các đối tượng này vào diện thu tiền sử dụng đất.