Theo đó, Khu kinh tế cửa khẩu tỉnh Cao Bằng có tổng diện tích tự nhiên là 30.130,34 ha, bao gồm 37 xã và 3 thị trấn thuộc các xã biên giới từ xã Đức Long huyện Thạch An đến xã Cần Nông của huyện Thông Nông.

Khu kinh tế cửa khẩu Cao Bằng được tổ chức thành khu phi thuế quan và các khu chức năng như: Khu cửa khẩu quốc tế, các khu công nghiệp, trung tâm tài chính, khu đô thị, khu trung tâm hành chính, khu dân cư và các khu chức năng khác.

Khu kinh tế cửa khẩu tỉnh Cao Bằng có phía Bắc giáp huyện Nà Po, Tịnh Tây (Quảng Tây - Trung Quốc); Phía Đông giáp huyện Long Châu, Đại Tân (Quảng Tây - Trung Quốc); Phía Nam giáp huyện Thạch An thuộc Cao Bằng; Phía Tây giáp huyện Bảo Lạc thuộc Cao Bằng.